Machu Picchu legfontosabb régészeti lelete az Intihuatana, egy sziklaoszlop, mely egy zongora méretű kőtömbből emelkedik ki. Intihuatana szó szerint azt jelenti "a nap megkötéséhez", és a téli napéjegyenlőségi szertartások során használták. Egy pap a szertartás keretében "a kőhöz kötötte a napot", nehogy az végleg eltűnjön. Ez az Intihuatana egyedi, mivel a többi hasonló építményt megsemmisítették a spanyol hódítók.

Machu Picchu mindmáig spirituális központ – sok perui sámán és misztikus használja. Azt állítják, a várost még mindig átjárja a mély energia, amely a nyári napéjegyenlőség és telihold idején a legerősebb. Csak kevés olyan látogató akad, aki anélkül hagyja ott e helyet, hogy átérezné annak titokzatosságát és hatalmát.